Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MSL3Q8N5Y2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms