Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SMIM20Q8N5G0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SMIM20Q8N5G0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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