Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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