Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf53Q8N3J3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms