Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms