Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTU1Q7Z7A3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms