Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT27Q7Z3Y8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms