Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STRCQ7RTU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
STRCQ7RTU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms