Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms