Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms