Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC141Q6ZP82 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC141Q6ZP82 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC141Q6ZP82 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC141Q6ZP82 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC141Q6ZP82 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms