Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms