Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARM1Q6SZW1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms