Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms