Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSANTD2Q6P1R3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD2Q6P1R3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms