Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1Q6P1K2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1Q6P1K2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1Q6P1K2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms