Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL1Q5VZK9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms