Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND4CQ5VZ89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND4CQ5VZ89 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms