Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms