Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms