Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPANXN1Q5VSR9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.4 ms