Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRIP1Q5VSL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms