Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAT6

COL13A1, Collagen alpha-1(XIII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL13A1Q5TAT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL13A1Q5TAT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL13A1Q5TAT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms