Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9C2Q5TAH2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9C2Q5TAH2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms