Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTH9

RRP12, RRP12-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP12Q5JTH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP12Q5JTH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms