Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms