Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD17B12Q53GQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms