Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms