Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms