Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf46Q504U0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms