Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms