Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2CQ496J9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2CQ496J9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms