Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRFIP1Q32MZ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRFIP1Q32MZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms