Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HFEQ30201 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HFEQ30201 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HFEQ30201 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HFEQ30201 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HFEQ30201 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms