Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETM2Q2VYF4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETM2Q2VYF4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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