Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX7Q2KHR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX7Q2KHR2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms