Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC142Q17RM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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