Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FXNQ16595 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FXNQ16595 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FXNQ16595 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FXNQ16595 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FXNQ16595 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FXNQ16595 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FXNQ16595 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FXNQ16595 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FXNQ16595 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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