Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SSX2Q16385 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SSX2Q16385 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX2Q16385 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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