Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA6Q15825 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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