Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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