Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF3A2Q15428 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3A2Q15428 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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