Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3CQ15386 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3CQ15386 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms