Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF1Q15361 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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