Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms