Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCF4Q15080 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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