Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCLAFQ15004 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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