Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1I3Q14994 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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