Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2CQ14957 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms