Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN1Q14699 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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